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GB/T 33767.14-2023 信息技术 生物特征样本质量 第14部分:DNA数据.pdf在以下测试条件下并使用以下测试方法对DNA分型数据进行准确性测试 a)测试条件: 1)目标区域的覆盖度不低于95%。 2)目标区域的深度不低于100倍。 b)测试方法:
、 运行DNA数据质量测试工具,打开需要测试的DNA分型数据文件,检测并得到DNA分 型数据中单个基因分型质量值GQ.和分型位点(基因座)总数nG。 根据DNA分型数据中单个基因分型质量值GQ.,按照公式(5)计算单个基因分型准 确率:
1n 一一DNA分型数据中单个基因分型准确率; GQ一一DNA分型数据中单个基因分型质量值。 3)由DNA分型数据中单个基因分型准确率,根据公式(6)计算DNA分型数据准确率:
应采用以下方式对DNA测序数据完备性进行测试: Ea) 1M7 检测是否包含样本信息文件,样本信息文件中是否包含对应的样本名称、样本类型; b) 检测是否包含测序关联信息文件,测序关联信息文件中是否包含测序仪器(编号、版本号)、测 序芯片标识、测序文库标识和DNA测序数据文件名称; 1MT 检测是否包含DNA测序数据文件; C· d) 检测是否具有DNA测序数据对应的MD5值; 检测以上文件是否具有备份文件
7.3.2DNA比对数据完备性测试
应采用以下方式对DNA比对数据完备性进行测试: Aa) 检测是否包含样本信息文件,样本信息文件中是否包含对应的样本名称、样本类型; b) 检测是否包含比对关联信息文件,测序关联信息文件中是否包含测序仪器(编号、版本号)、测 序芯片标识、测序文库标识、DNA测序数据文件名称和DNA比对数据文件名称; c)检测是否包含DNA比对数据文件; d) 检测是否具有DNA比对数据对应的MD5值; e) 检测以上文件是否具有备份文件
7.3.3DNA分型数据完备性测试
应采用以下方式对DNA分型数据完备性进行测试: a) 检测是否包含样本信息文件,样本信息文件中是否包含对应的样本名称、样本类型; b)检测是否包含分型关联信息文件,分型关联信息文件中是否包含测序仪器(编号、版本号)、测 序芯片标识、测序文库标识、DNA测序数据文件名称、DNA比对数据文件名称和DNA分型 数据文件名称; c)检测是否包含DNA分型数据文件; d)检测是否具有DNA分型数据对应的MD5值;
北京经济技术开发区河西区X88R1地块二类居住(配建公共租赁住房)项目地下结构模板施工方案e) 检测以上文件是否具有备份文件。
7.4DNA数据可溯性测试方法
DNA测序数据、DNA比对数据和DNA分型数据可追溯性的测试方法如下: a)运行DNA数据质量测试工具,生成所有DNA数据的文件名称和MD5值; b)打开测序关联信息文件、比对关联信息文件、分型关联信息文件,检测各个关联信息文件中的 所有DNA数据的MD5值与DNA数据质量测试工具生成的所有DNA数据的文件名称和 MD5值的一致性; c)打开DNA测序数据样本信息文件、DNA比对数据样本信息文件、DNA分型数据样本信息文 件,检测各个样本信息文件中的样本名称、样本类型与样本原始信息是否一致。
DNA测序数据、DNA比对数据和DNA分型数据可追溯性的测试方法如下: a)运行DNA数据质量测试工具,生成所有DNA数据的文件名称和MD5值; b)打开测序关联信息文件、比对关联信息文件、分型关联信息文件,检测各个关联信息文件中的 所有DNA数据的MD5值与DNA数据质量测试工具生成的所有DNA数据的文件名称和 MD5值的一致性; c)打开DNA测序数据样本信息文件、DNA比对数据样本信息文件、DNA分型数据样本信息文 件,检测各个样本信息文件中的样本名称、样本类型与样本原始信息是否一致。
1 GB/T26237.14—2019信息技术 生物特征识别数据交换格式第14部分:DNA数据 2] GB/T29859一2013生物信息学术语 3] GB/T30989一2014高通量基因测序技术规程 [4]GB/T36344—2018信息技术 数据质量评价指标